Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBM1

PEMT, Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEMTQ9UBM1 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PEMTQ9UBM1 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PEMTQ9UBM1 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PEMTQ9UBM1 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PEMTQ9UBM1 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PEMTQ9UBM1 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PEMTQ9UBM1 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PEMTQ9UBM1 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PEMTQ9UBM1 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PEMTQ9UBM1 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PEMTQ9UBM1 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PEMTQ9UBM1 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PEMTQ9UBM1 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PEMTQ9UBM1 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
PEMTQ9UBM1 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
PEMTQ9UBM1 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
PEMTQ9UBM1 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
PEMTQ9UBM1 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PEMTQ9UBM1 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PEMTQ9UBM1 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PEMTQ9UBM1 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PEMTQ9UBM1 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PEMTQ9UBM1 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PEMTQ9UBM1 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PEMTQ9UBM1 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PEMTQ9UBM1 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PEMTQ9UBM1 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PEMTQ9UBM1 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PEMTQ9UBM1 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PEMTQ9UBM1 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PEMTQ9UBM1 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PEMTQ9UBM1 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PEMTQ9UBM1 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PEMTQ9UBM1 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PEMTQ9UBM1 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PEMTQ9UBM1 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PEMTQ9UBM1 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PEMTQ9UBM1 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PEMTQ9UBM1 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PEMTQ9UBM1 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PEMTQ9UBM1 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PEMTQ9UBM1 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PEMTQ9UBM1 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PEMTQ9UBM1 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PEMTQ9UBM1 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PEMTQ9UBM1 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PEMTQ9UBM1 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PEMTQ9UBM1 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PEMTQ9UBM1 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PEMTQ9UBM1 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PEMTQ9UBM1 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PEMTQ9UBM1 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PEMTQ9UBM1 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PEMTQ9UBM1 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PEMTQ9UBM1 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PEMTQ9UBM1 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PEMTQ9UBM1 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PEMTQ9UBM1 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PEMTQ9UBM1 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PEMTQ9UBM1 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PEMTQ9UBM1 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PEMTQ9UBM1 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PEMTQ9UBM1 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PEMTQ9UBM1 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PEMTQ9UBM1 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PEMTQ9UBM1 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PEMTQ9UBM1 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PEMTQ9UBM1 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PEMTQ9UBM1 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PEMTQ9UBM1 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PEMTQ9UBM1 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PEMTQ9UBM1 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PEMTQ9UBM1 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PEMTQ9UBM1 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PEMTQ9UBM1 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PEMTQ9UBM1 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PEMTQ9UBM1 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PEMTQ9UBM1 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PEMTQ9UBM1 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PEMTQ9UBM1 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PEMTQ9UBM1 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PEMTQ9UBM1 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PEMTQ9UBM1 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PEMTQ9UBM1 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PEMTQ9UBM1 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PEMTQ9UBM1 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PEMTQ9UBM1 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PEMTQ9UBM1 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PEMTQ9UBM1 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PEMTQ9UBM1 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PEMTQ9UBM1 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PEMTQ9UBM1 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PEMTQ9UBM1 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PEMTQ9UBM1 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PEMTQ9UBM1 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PEMTQ9UBM1 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PEMTQ9UBM1 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PEMTQ9UBM1 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PEMTQ9UBM1 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
PEMTQ9UBM1 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms