Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms