Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2X8

LINC00474, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00474, humanhuman

Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00474Q9P2X8 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms