Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RRBP1Q9P2E9 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms