Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXG0

CNTLN, Centlein, humanhuman

Predictions only

Length 1,405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTLNQ9NXG0 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms