Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXB0

MKS1, Meckel syndrome type 1 protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKS1Q9NXB0 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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