Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX09

DDIT4, DNA damage-inducible transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT4Q9NX09 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms