Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPY3

CD93, Complement component C1q receptor, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD93Q9NPY3 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD93Q9NPY3 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD93Q9NPY3 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CD93Q9NPY3 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD93Q9NPY3 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CD93Q9NPY3 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD93Q9NPY3 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD93Q9NPY3 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD93Q9NPY3 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD93Q9NPY3 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD93Q9NPY3 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD93Q9NPY3 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD93Q9NPY3 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD93Q9NPY3 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD93Q9NPY3 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD93Q9NPY3 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD93Q9NPY3 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD93Q9NPY3 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD93Q9NPY3 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD93Q9NPY3 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD93Q9NPY3 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD93Q9NPY3 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD93Q9NPY3 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD93Q9NPY3 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD93Q9NPY3 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD93Q9NPY3 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD93Q9NPY3 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD93Q9NPY3 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD93Q9NPY3 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD93Q9NPY3 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD93Q9NPY3 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD93Q9NPY3 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD93Q9NPY3 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD93Q9NPY3 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD93Q9NPY3 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD93Q9NPY3 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
CD93Q9NPY3 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD93Q9NPY3 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD93Q9NPY3 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD93Q9NPY3 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD93Q9NPY3 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD93Q9NPY3 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD93Q9NPY3 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD93Q9NPY3 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD93Q9NPY3 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD93Q9NPY3 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CD93Q9NPY3 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD93Q9NPY3 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD93Q9NPY3 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CD93Q9NPY3 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD93Q9NPY3 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD93Q9NPY3 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD93Q9NPY3 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD93Q9NPY3 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD93Q9NPY3 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD93Q9NPY3 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD93Q9NPY3 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD93Q9NPY3 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD93Q9NPY3 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CD93Q9NPY3 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CD93Q9NPY3 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD93Q9NPY3 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD93Q9NPY3 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD93Q9NPY3 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD93Q9NPY3 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD93Q9NPY3 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD93Q9NPY3 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD93Q9NPY3 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD93Q9NPY3 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD93Q9NPY3 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD93Q9NPY3 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD93Q9NPY3 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD93Q9NPY3 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD93Q9NPY3 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD93Q9NPY3 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD93Q9NPY3 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD93Q9NPY3 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD93Q9NPY3 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD93Q9NPY3 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD93Q9NPY3 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD93Q9NPY3 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD93Q9NPY3 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD93Q9NPY3 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD93Q9NPY3 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD93Q9NPY3 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD93Q9NPY3 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD93Q9NPY3 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD93Q9NPY3 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD93Q9NPY3 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD93Q9NPY3 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD93Q9NPY3 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD93Q9NPY3 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD93Q9NPY3 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD93Q9NPY3 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD93Q9NPY3 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD93Q9NPY3 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD93Q9NPY3 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD93Q9NPY3 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD93Q9NPY3 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD93Q9NPY3 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms