Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB18Q9NP72 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms