Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM5Q9C035 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM5Q9C035 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM5Q9C035 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM5Q9C035 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM5Q9C035 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM5Q9C035 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM5Q9C035 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM5Q9C035 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM5Q9C035 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM5Q9C035 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM5Q9C035 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM5Q9C035 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM5Q9C035 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM5Q9C035 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM5Q9C035 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM5Q9C035 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM5Q9C035 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM5Q9C035 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM5Q9C035 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM5Q9C035 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM5Q9C035 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM5Q9C035 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM5Q9C035 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM5Q9C035 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM5Q9C035 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM5Q9C035 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM5Q9C035 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM5Q9C035 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM5Q9C035 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM5Q9C035 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM5Q9C035 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM5Q9C035 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM5Q9C035 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM5Q9C035 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM5Q9C035 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM5Q9C035 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM5Q9C035 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM5Q9C035 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM5Q9C035 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM5Q9C035 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM5Q9C035 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM5Q9C035 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM5Q9C035 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM5Q9C035 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM5Q9C035 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM5Q9C035 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM5Q9C035 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM5Q9C035 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM5Q9C035 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM5Q9C035 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM5Q9C035 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM5Q9C035 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM5Q9C035 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM5Q9C035 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM5Q9C035 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM5Q9C035 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM5Q9C035 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM5Q9C035 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM5Q9C035 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms