Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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FOXQ1Q9C009 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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FOXQ1Q9C009 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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FOXQ1Q9C009 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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FOXQ1Q9C009 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
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FOXQ1Q9C009 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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FOXQ1Q9C009 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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FOXQ1Q9C009 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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FOXQ1Q9C009 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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