Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms