Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 MEP1A-201ENST00000230588 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 ABCB9-201ENST00000280560 3517 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 AC021218.1-201ENST00000377722 2536 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 AL357140.3-201ENST00000639753 1983 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 AC027020.2-201ENST00000602585 2389 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 LLGL1-203ENST00000621229 3187 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 MCL1-204ENST00000620947 3626 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 RBM10-206ENST00000628161 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 CTCFL-218ENST00000608440 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms