Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TDRD1Q9BXT4 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TDRD1Q9BXT4 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TDRD1Q9BXT4 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TDRD1Q9BXT4 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TDRD1Q9BXT4 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TDRD1Q9BXT4 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TDRD1Q9BXT4 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TDRD1Q9BXT4 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TDRD1Q9BXT4 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TDRD1Q9BXT4 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TDRD1Q9BXT4 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TDRD1Q9BXT4 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TDRD1Q9BXT4 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TDRD1Q9BXT4 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TDRD1Q9BXT4 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TDRD1Q9BXT4 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TDRD1Q9BXT4 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TDRD1Q9BXT4 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TDRD1Q9BXT4 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TDRD1Q9BXT4 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TDRD1Q9BXT4 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TDRD1Q9BXT4 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TDRD1Q9BXT4 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TDRD1Q9BXT4 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TDRD1Q9BXT4 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TDRD1Q9BXT4 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TDRD1Q9BXT4 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TDRD1Q9BXT4 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TDRD1Q9BXT4 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TDRD1Q9BXT4 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TDRD1Q9BXT4 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TDRD1Q9BXT4 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TDRD1Q9BXT4 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TDRD1Q9BXT4 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TDRD1Q9BXT4 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TDRD1Q9BXT4 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TDRD1Q9BXT4 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TDRD1Q9BXT4 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TDRD1Q9BXT4 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TDRD1Q9BXT4 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TDRD1Q9BXT4 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TDRD1Q9BXT4 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TDRD1Q9BXT4 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TDRD1Q9BXT4 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TDRD1Q9BXT4 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TDRD1Q9BXT4 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TDRD1Q9BXT4 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TDRD1Q9BXT4 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TDRD1Q9BXT4 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TDRD1Q9BXT4 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TDRD1Q9BXT4 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TDRD1Q9BXT4 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TDRD1Q9BXT4 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TDRD1Q9BXT4 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TDRD1Q9BXT4 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TDRD1Q9BXT4 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TDRD1Q9BXT4 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TDRD1Q9BXT4 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TDRD1Q9BXT4 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TDRD1Q9BXT4 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TDRD1Q9BXT4 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TDRD1Q9BXT4 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TDRD1Q9BXT4 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TDRD1Q9BXT4 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TDRD1Q9BXT4 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TDRD1Q9BXT4 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TDRD1Q9BXT4 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TDRD1Q9BXT4 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TDRD1Q9BXT4 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TDRD1Q9BXT4 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TDRD1Q9BXT4 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TDRD1Q9BXT4 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TDRD1Q9BXT4 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TDRD1Q9BXT4 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TDRD1Q9BXT4 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TDRD1Q9BXT4 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TDRD1Q9BXT4 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TDRD1Q9BXT4 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TDRD1Q9BXT4 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TDRD1Q9BXT4 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TDRD1Q9BXT4 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TDRD1Q9BXT4 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TDRD1Q9BXT4 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TDRD1Q9BXT4 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TDRD1Q9BXT4 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TDRD1Q9BXT4 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TDRD1Q9BXT4 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TDRD1Q9BXT4 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TDRD1Q9BXT4 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TDRD1Q9BXT4 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TDRD1Q9BXT4 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TDRD1Q9BXT4 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TDRD1Q9BXT4 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TDRD1Q9BXT4 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TDRD1Q9BXT4 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TDRD1Q9BXT4 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TDRD1Q9BXT4 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TDRD1Q9BXT4 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TDRD1Q9BXT4 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms