Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSA9

TMEM175, Endosomal/lysosomal potassium channel TMEM175, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM175Q9BSA9 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM175Q9BSA9 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM175Q9BSA9 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM175Q9BSA9 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM175Q9BSA9 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM175Q9BSA9 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM175Q9BSA9 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM175Q9BSA9 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM175Q9BSA9 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM175Q9BSA9 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM175Q9BSA9 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM175Q9BSA9 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM175Q9BSA9 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM175Q9BSA9 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM175Q9BSA9 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM175Q9BSA9 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM175Q9BSA9 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM175Q9BSA9 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM175Q9BSA9 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM175Q9BSA9 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM175Q9BSA9 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM175Q9BSA9 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM175Q9BSA9 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM175Q9BSA9 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM175Q9BSA9 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM175Q9BSA9 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM175Q9BSA9 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM175Q9BSA9 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM175Q9BSA9 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM175Q9BSA9 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM175Q9BSA9 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM175Q9BSA9 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM175Q9BSA9 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM175Q9BSA9 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM175Q9BSA9 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM175Q9BSA9 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM175Q9BSA9 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM175Q9BSA9 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM175Q9BSA9 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM175Q9BSA9 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM175Q9BSA9 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM175Q9BSA9 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM175Q9BSA9 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM175Q9BSA9 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM175Q9BSA9 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM175Q9BSA9 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM175Q9BSA9 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM175Q9BSA9 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM175Q9BSA9 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM175Q9BSA9 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM175Q9BSA9 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM175Q9BSA9 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM175Q9BSA9 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM175Q9BSA9 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM175Q9BSA9 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM175Q9BSA9 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM175Q9BSA9 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM175Q9BSA9 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM175Q9BSA9 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM175Q9BSA9 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM175Q9BSA9 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM175Q9BSA9 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM175Q9BSA9 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM175Q9BSA9 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM175Q9BSA9 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM175Q9BSA9 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM175Q9BSA9 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM175Q9BSA9 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM175Q9BSA9 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM175Q9BSA9 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM175Q9BSA9 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM175Q9BSA9 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM175Q9BSA9 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM175Q9BSA9 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM175Q9BSA9 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM175Q9BSA9 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM175Q9BSA9 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM175Q9BSA9 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM175Q9BSA9 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM175Q9BSA9 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM175Q9BSA9 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM175Q9BSA9 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM175Q9BSA9 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM175Q9BSA9 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM175Q9BSA9 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM175Q9BSA9 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM175Q9BSA9 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM175Q9BSA9 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM175Q9BSA9 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM175Q9BSA9 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM175Q9BSA9 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM175Q9BSA9 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM175Q9BSA9 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM175Q9BSA9 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM175Q9BSA9 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM175Q9BSA9 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM175Q9BSA9 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM175Q9BSA9 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM175Q9BSA9 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM175Q9BSA9 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms