Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KCNS3Q9BQ31 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
KCNS3Q9BQ31 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KCNS3Q9BQ31 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KCNS3Q9BQ31 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KCNS3Q9BQ31 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KCNS3Q9BQ31 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
KCNS3Q9BQ31 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KCNS3Q9BQ31 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
KCNS3Q9BQ31 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
KCNS3Q9BQ31 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KCNS3Q9BQ31 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KCNS3Q9BQ31 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KCNS3Q9BQ31 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KCNS3Q9BQ31 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KCNS3Q9BQ31 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KCNS3Q9BQ31 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
KCNS3Q9BQ31 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KCNS3Q9BQ31 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
KCNS3Q9BQ31 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KCNS3Q9BQ31 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
KCNS3Q9BQ31 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KCNS3Q9BQ31 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KCNS3Q9BQ31 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KCNS3Q9BQ31 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KCNS3Q9BQ31 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KCNS3Q9BQ31 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KCNS3Q9BQ31 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KCNS3Q9BQ31 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms