Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC9.68□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC9.68□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC9.68□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC9.68□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC9.68□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 EIF3A-201ENST00000369144 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 SPTBN2-209ENST00000533211 8128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC9.67□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms