Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms