Protein–RNA interactions for Protein: Q96GR2

ACSBG1, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase ACSBG1, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSBG1Q96GR2 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACSBG1Q96GR2 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACSBG1Q96GR2 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACSBG1Q96GR2 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACSBG1Q96GR2 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACSBG1Q96GR2 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACSBG1Q96GR2 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ACSBG1Q96GR2 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACSBG1Q96GR2 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACSBG1Q96GR2 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACSBG1Q96GR2 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACSBG1Q96GR2 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACSBG1Q96GR2 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACSBG1Q96GR2 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ACSBG1Q96GR2 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACSBG1Q96GR2 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACSBG1Q96GR2 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACSBG1Q96GR2 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACSBG1Q96GR2 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACSBG1Q96GR2 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACSBG1Q96GR2 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACSBG1Q96GR2 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACSBG1Q96GR2 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACSBG1Q96GR2 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACSBG1Q96GR2 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACSBG1Q96GR2 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACSBG1Q96GR2 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACSBG1Q96GR2 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACSBG1Q96GR2 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACSBG1Q96GR2 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ACSBG1Q96GR2 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACSBG1Q96GR2 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACSBG1Q96GR2 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACSBG1Q96GR2 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACSBG1Q96GR2 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACSBG1Q96GR2 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACSBG1Q96GR2 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACSBG1Q96GR2 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACSBG1Q96GR2 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACSBG1Q96GR2 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACSBG1Q96GR2 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACSBG1Q96GR2 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACSBG1Q96GR2 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACSBG1Q96GR2 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACSBG1Q96GR2 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACSBG1Q96GR2 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACSBG1Q96GR2 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACSBG1Q96GR2 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACSBG1Q96GR2 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ACSBG1Q96GR2 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ACSBG1Q96GR2 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACSBG1Q96GR2 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ACSBG1Q96GR2 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ACSBG1Q96GR2 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACSBG1Q96GR2 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACSBG1Q96GR2 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACSBG1Q96GR2 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACSBG1Q96GR2 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACSBG1Q96GR2 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACSBG1Q96GR2 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACSBG1Q96GR2 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACSBG1Q96GR2 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ACSBG1Q96GR2 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACSBG1Q96GR2 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACSBG1Q96GR2 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACSBG1Q96GR2 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACSBG1Q96GR2 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACSBG1Q96GR2 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACSBG1Q96GR2 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACSBG1Q96GR2 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACSBG1Q96GR2 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACSBG1Q96GR2 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACSBG1Q96GR2 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACSBG1Q96GR2 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACSBG1Q96GR2 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACSBG1Q96GR2 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACSBG1Q96GR2 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACSBG1Q96GR2 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACSBG1Q96GR2 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACSBG1Q96GR2 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACSBG1Q96GR2 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACSBG1Q96GR2 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACSBG1Q96GR2 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACSBG1Q96GR2 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACSBG1Q96GR2 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ACSBG1Q96GR2 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ACSBG1Q96GR2 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACSBG1Q96GR2 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACSBG1Q96GR2 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACSBG1Q96GR2 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ACSBG1Q96GR2 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACSBG1Q96GR2 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACSBG1Q96GR2 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACSBG1Q96GR2 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACSBG1Q96GR2 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACSBG1Q96GR2 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACSBG1Q96GR2 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACSBG1Q96GR2 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACSBG1Q96GR2 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACSBG1Q96GR2 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms