Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms