Protein–RNA interactions for Protein: Q92542

NCSTN, Nicastrin, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCSTNQ92542 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCSTNQ92542 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms