Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHG7

SVIP, Small VCP/p97-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVIPQ8NHG7 RGS9-203ENST00000449996 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
SVIPQ8NHG7 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
SVIPQ8NHG7 MTFR1L-201ENST00000374300 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
SVIPQ8NHG7 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
SVIPQ8NHG7 ABCA8-208ENST00000586539 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
SVIPQ8NHG7 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
SVIPQ8NHG7 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
SVIPQ8NHG7 CRP-201ENST00000255030 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
SVIPQ8NHG7 FAM157A-203ENST00000634862 6083 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
SVIPQ8NHG7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 COX7A2L-202ENST00000378669 3056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 ADIRF-AS1-203ENST00000609111 3822 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 CLUAP1-203ENST00000572600 2221 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 SHROOM3-201ENST00000296043 11020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 CYP4F3-206ENST00000591058 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 AC092819.1-201ENST00000519981 1690 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 SERPINE1-201ENST00000223095 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 ADAM8-201ENST00000415217 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 DIDO1-205ENST00000370371 2833 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 DOCK4-204ENST00000428084 7997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 DCDC2-202ENST00000378454 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 MAB21L1-201ENST00000379919 3028 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 LINC01987-201ENST00000593118 2281 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 CYP4F12-215ENST00000550308 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 KIF9-208ENST00000452770 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 SHANK2-211ENST00000449833 8850 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 ZNF589-201ENST00000354698 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 AL512383.1-201ENST00000624175 2677 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 RNU6-673P-201ENST00000365084 104 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 FAM131B-203ENST00000409408 5856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 CUL1-202ENST00000409469 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 ADH5-201ENST00000296412 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 CACNA1G-222ENST00000510366 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 CACNA1G-227ENST00000513964 6735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 UNC13B-207ENST00000619578 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 SPRTN-202ENST00000295050 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 MICAL1-208ENST00000630715 3678 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 CDK5RAP2-201ENST00000349780 6228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 LINC01777-201ENST00000423197 2077 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 OAS2-203ENST00000449768 2072 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 PDE12-201ENST00000311180 8773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 MYT1L-204ENST00000428368 4850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 AC023449.2-201ENST00000620538 2400 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 LASP1-204ENST00000435347 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 RNF43-208ENST00000584437 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 AC107959.2-201ENST00000501897 2636 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 TTYH2-202ENST00000441391 3661 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 EPB41L2-205ENST00000445890 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 MOV10L1-210ENST00000545383 3889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 AL161756.1-201ENST00000555861 1751 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 TLE3-220ENST00000559929 3408 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 SDCCAG8-201ENST00000366541 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 TRAPPC2-203ENST00000380579 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 ZNF226-215ENST00000590089 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 HECW1-201ENST00000395891 9501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 PMEL-218ENST00000552882 2516 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 AOC1-207ENST00000493429 3135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 CDK10-201ENST00000331006 3344 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 SLC13A4-201ENST00000354042 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 POLN-201ENST00000382865 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 SERPINA10-202ENST00000393096 2451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SVIPQ8NHG7 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.7 ms