Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MYRIPQ8NFW9 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MYRIPQ8NFW9 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MYRIPQ8NFW9 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MYRIPQ8NFW9 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MYRIPQ8NFW9 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MYRIPQ8NFW9 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MYRIPQ8NFW9 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MYRIPQ8NFW9 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MYRIPQ8NFW9 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MYRIPQ8NFW9 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MYRIPQ8NFW9 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MYRIPQ8NFW9 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MYRIPQ8NFW9 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
MYRIPQ8NFW9 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MYRIPQ8NFW9 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MYRIPQ8NFW9 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MYRIPQ8NFW9 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MYRIPQ8NFW9 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MYRIPQ8NFW9 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MYRIPQ8NFW9 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MYRIPQ8NFW9 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MYRIPQ8NFW9 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
MYRIPQ8NFW9 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MYRIPQ8NFW9 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MYRIPQ8NFW9 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MYRIPQ8NFW9 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
MYRIPQ8NFW9 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MYRIPQ8NFW9 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MYRIPQ8NFW9 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MYRIPQ8NFW9 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MYRIPQ8NFW9 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MYRIPQ8NFW9 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MYRIPQ8NFW9 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MYRIPQ8NFW9 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MYRIPQ8NFW9 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MYRIPQ8NFW9 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MYRIPQ8NFW9 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MYRIPQ8NFW9 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MYRIPQ8NFW9 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MYRIPQ8NFW9 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MYRIPQ8NFW9 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MYRIPQ8NFW9 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MYRIPQ8NFW9 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MYRIPQ8NFW9 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MYRIPQ8NFW9 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MYRIPQ8NFW9 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MYRIPQ8NFW9 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MYRIPQ8NFW9 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MYRIPQ8NFW9 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MYRIPQ8NFW9 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MYRIPQ8NFW9 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MYRIPQ8NFW9 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MYRIPQ8NFW9 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MYRIPQ8NFW9 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MYRIPQ8NFW9 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MYRIPQ8NFW9 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MYRIPQ8NFW9 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MYRIPQ8NFW9 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MYRIPQ8NFW9 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MYRIPQ8NFW9 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MYRIPQ8NFW9 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MYRIPQ8NFW9 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MYRIPQ8NFW9 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MYRIPQ8NFW9 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MYRIPQ8NFW9 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MYRIPQ8NFW9 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
MYRIPQ8NFW9 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MYRIPQ8NFW9 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MYRIPQ8NFW9 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MYRIPQ8NFW9 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MYRIPQ8NFW9 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MYRIPQ8NFW9 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MYRIPQ8NFW9 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MYRIPQ8NFW9 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MYRIPQ8NFW9 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MYRIPQ8NFW9 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MYRIPQ8NFW9 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MYRIPQ8NFW9 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MYRIPQ8NFW9 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MYRIPQ8NFW9 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MYRIPQ8NFW9 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MYRIPQ8NFW9 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MYRIPQ8NFW9 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MYRIPQ8NFW9 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MYRIPQ8NFW9 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MYRIPQ8NFW9 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MYRIPQ8NFW9 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MYRIPQ8NFW9 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MYRIPQ8NFW9 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MYRIPQ8NFW9 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MYRIPQ8NFW9 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MYRIPQ8NFW9 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MYRIPQ8NFW9 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MYRIPQ8NFW9 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MYRIPQ8NFW9 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MYRIPQ8NFW9 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MYRIPQ8NFW9 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MYRIPQ8NFW9 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MYRIPQ8NFW9 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms