Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms