Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN19Q8N6F1 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms