Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4P3

HDDC3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, humanhuman

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3Q8N4P3 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDDC3Q8N4P3 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDDC3Q8N4P3 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDDC3Q8N4P3 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDDC3Q8N4P3 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDDC3Q8N4P3 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDDC3Q8N4P3 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HDDC3Q8N4P3 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDDC3Q8N4P3 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDDC3Q8N4P3 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDDC3Q8N4P3 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDDC3Q8N4P3 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDDC3Q8N4P3 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDDC3Q8N4P3 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDDC3Q8N4P3 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDDC3Q8N4P3 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDDC3Q8N4P3 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDDC3Q8N4P3 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDDC3Q8N4P3 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDDC3Q8N4P3 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDDC3Q8N4P3 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDDC3Q8N4P3 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDDC3Q8N4P3 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDDC3Q8N4P3 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDDC3Q8N4P3 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDDC3Q8N4P3 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDDC3Q8N4P3 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDDC3Q8N4P3 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDDC3Q8N4P3 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDDC3Q8N4P3 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDDC3Q8N4P3 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDDC3Q8N4P3 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDDC3Q8N4P3 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDDC3Q8N4P3 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDDC3Q8N4P3 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDDC3Q8N4P3 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDDC3Q8N4P3 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDDC3Q8N4P3 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDDC3Q8N4P3 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDDC3Q8N4P3 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDDC3Q8N4P3 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDDC3Q8N4P3 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDDC3Q8N4P3 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDDC3Q8N4P3 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDDC3Q8N4P3 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDDC3Q8N4P3 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDDC3Q8N4P3 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDDC3Q8N4P3 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDDC3Q8N4P3 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDDC3Q8N4P3 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDDC3Q8N4P3 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HDDC3Q8N4P3 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDDC3Q8N4P3 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDDC3Q8N4P3 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HDDC3Q8N4P3 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDDC3Q8N4P3 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDDC3Q8N4P3 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDDC3Q8N4P3 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDDC3Q8N4P3 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDDC3Q8N4P3 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDDC3Q8N4P3 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDDC3Q8N4P3 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDDC3Q8N4P3 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDDC3Q8N4P3 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDDC3Q8N4P3 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDDC3Q8N4P3 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDDC3Q8N4P3 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDDC3Q8N4P3 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDDC3Q8N4P3 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDDC3Q8N4P3 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDDC3Q8N4P3 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDDC3Q8N4P3 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDDC3Q8N4P3 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDDC3Q8N4P3 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDDC3Q8N4P3 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDDC3Q8N4P3 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDDC3Q8N4P3 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HDDC3Q8N4P3 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDDC3Q8N4P3 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDDC3Q8N4P3 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDDC3Q8N4P3 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDDC3Q8N4P3 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDDC3Q8N4P3 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDDC3Q8N4P3 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDDC3Q8N4P3 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDDC3Q8N4P3 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDDC3Q8N4P3 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDDC3Q8N4P3 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HDDC3Q8N4P3 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HDDC3Q8N4P3 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDDC3Q8N4P3 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HDDC3Q8N4P3 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDDC3Q8N4P3 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDDC3Q8N4P3 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDDC3Q8N4P3 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDDC3Q8N4P3 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDDC3Q8N4P3 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDDC3Q8N4P3 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDDC3Q8N4P3 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDDC3Q8N4P3 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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