Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWV2

CNTN4, Contactin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN4Q8IWV2 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms