Protein–RNA interactions for Protein: Q86SS6

SYT9, Synaptotagmin-9, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT9Q86SS6 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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SYT9Q86SS6 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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SYT9Q86SS6 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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SYT9Q86SS6 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
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SYT9Q86SS6 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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SYT9Q86SS6 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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SYT9Q86SS6 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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SYT9Q86SS6 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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SYT9Q86SS6 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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