Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 212.5 ms