Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HECW1Q76N89 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms