Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms