Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms