Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms