Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3C3

TMEM164, Transmembrane protein 164, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM164Q5U3C3 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms