Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

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Length 151 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
C10orf55Q5SWW7 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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C10orf55Q5SWW7 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
C10orf55Q5SWW7 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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