Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms