Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PCID2Q5JVF3 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms