Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBL2

ZNF628, Zinc finger protein 628, humanhuman

Predictions only

Length 1,059 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF628Q5EBL2 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms