Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IMPG1Q17R60 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms