Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP2B3Q16720 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP2B3Q16720 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP2B3Q16720 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP2B3Q16720 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP2B3Q16720 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP2B3Q16720 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP2B3Q16720 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP2B3Q16720 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP2B3Q16720 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP2B3Q16720 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP2B3Q16720 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP2B3Q16720 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP2B3Q16720 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP2B3Q16720 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP2B3Q16720 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP2B3Q16720 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP2B3Q16720 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP2B3Q16720 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP2B3Q16720 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP2B3Q16720 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP2B3Q16720 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP2B3Q16720 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP2B3Q16720 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP2B3Q16720 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP2B3Q16720 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP2B3Q16720 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP2B3Q16720 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP2B3Q16720 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP2B3Q16720 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP2B3Q16720 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATP2B3Q16720 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATP2B3Q16720 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATP2B3Q16720 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATP2B3Q16720 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATP2B3Q16720 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATP2B3Q16720 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATP2B3Q16720 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATP2B3Q16720 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATP2B3Q16720 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATP2B3Q16720 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATP2B3Q16720 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATP2B3Q16720 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATP2B3Q16720 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATP2B3Q16720 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
ATP2B3Q16720 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
ATP2B3Q16720 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATP2B3Q16720 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATP2B3Q16720 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATP2B3Q16720 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATP2B3Q16720 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATP2B3Q16720 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATP2B3Q16720 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATP2B3Q16720 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATP2B3Q16720 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATP2B3Q16720 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATP2B3Q16720 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATP2B3Q16720 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATP2B3Q16720 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATP2B3Q16720 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATP2B3Q16720 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATP2B3Q16720 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATP2B3Q16720 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
ATP2B3Q16720 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATP2B3Q16720 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATP2B3Q16720 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATP2B3Q16720 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATP2B3Q16720 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATP2B3Q16720 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATP2B3Q16720 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATP2B3Q16720 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATP2B3Q16720 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATP2B3Q16720 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATP2B3Q16720 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATP2B3Q16720 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATP2B3Q16720 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATP2B3Q16720 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
ATP2B3Q16720 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATP2B3Q16720 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
ATP2B3Q16720 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATP2B3Q16720 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATP2B3Q16720 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATP2B3Q16720 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
ATP2B3Q16720 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATP2B3Q16720 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATP2B3Q16720 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATP2B3Q16720 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATP2B3Q16720 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATP2B3Q16720 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATP2B3Q16720 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATP2B3Q16720 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATP2B3Q16720 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATP2B3Q16720 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATP2B3Q16720 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATP2B3Q16720 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATP2B3Q16720 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATP2B3Q16720 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATP2B3Q16720 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATP2B3Q16720 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATP2B3Q16720 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
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