Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NRF1Q16656 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NRF1Q16656 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NRF1Q16656 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms