Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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SGCAQ16586 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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SGCAQ16586 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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SGCAQ16586 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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SGCAQ16586 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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SGCAQ16586 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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SGCAQ16586 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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