Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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SNAPC1Q16533 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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SNAPC1Q16533 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SNAPC1Q16533 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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