Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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ATP6AP1Q15904 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.07■□□□□ 0
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ATP6AP1Q15904 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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ATP6AP1Q15904 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
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