Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP4Q15650 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms