Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

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Length 398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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CYTH1Q15438 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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CYTH1Q15438 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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CYTH1Q15438 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYTH1Q15438 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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