Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
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