Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COL4A6Q14031 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COL4A6Q14031 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COL4A6Q14031 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COL4A6Q14031 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COL4A6Q14031 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COL4A6Q14031 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COL4A6Q14031 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COL4A6Q14031 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COL4A6Q14031 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COL4A6Q14031 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COL4A6Q14031 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
COL4A6Q14031 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COL4A6Q14031 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COL4A6Q14031 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COL4A6Q14031 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COL4A6Q14031 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COL4A6Q14031 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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COL4A6Q14031 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COL4A6Q14031 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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COL4A6Q14031 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COL4A6Q14031 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
COL4A6Q14031 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COL4A6Q14031 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COL4A6Q14031 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COL4A6Q14031 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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COL4A6Q14031 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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COL4A6Q14031 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COL4A6Q14031 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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COL4A6Q14031 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
COL4A6Q14031 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COL4A6Q14031 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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COL4A6Q14031 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COL4A6Q14031 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COL4A6Q14031 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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COL4A6Q14031 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COL4A6Q14031 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COL4A6Q14031 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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COL4A6Q14031 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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COL4A6Q14031 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
COL4A6Q14031 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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COL4A6Q14031 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
COL4A6Q14031 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
COL4A6Q14031 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
COL4A6Q14031 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
COL4A6Q14031 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
COL4A6Q14031 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
COL4A6Q14031 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
COL4A6Q14031 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
COL4A6Q14031 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
COL4A6Q14031 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
COL4A6Q14031 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
COL4A6Q14031 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
COL4A6Q14031 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
COL4A6Q14031 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
COL4A6Q14031 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
COL4A6Q14031 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
COL4A6Q14031 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
COL4A6Q14031 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
COL4A6Q14031 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
COL4A6Q14031 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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COL4A6Q14031 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
COL4A6Q14031 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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