Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SHROOM2Q13796 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHROOM2Q13796 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
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