Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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